熱原體綱(Thermoplasmata)是廣古菌超門分布廣泛且具有重要生態(tài)學(xué)功能的一個(gè)綱。由于有限的純培養(yǎng)物和基因組數(shù)據(jù),很多未鑒定的熱原體綱分支的代謝潛能和進(jìn)化關(guān)系仍然未知。在這項(xiàng)研究中,微生物研究所許玫英研究員的科研團(tuán)隊(duì)從廣東省佛山市容桂鎮(zhèn)的一條黑臭河流沉積物的宏基因組中構(gòu)建出了4個(gè)中高質(zhì)量的熱原體綱古菌基因組,隸屬于先前一個(gè)未鑒定的分支UBA10834。隨后該團(tuán)隊(duì)聯(lián)合深圳大學(xué)李猛研究團(tuán)隊(duì)對(duì)這一分支的系統(tǒng)分類學(xué)及其代謝潛能進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)廣微原體目具有混合營養(yǎng)生活方式的潛能:即同化甲醛和乙酸的異養(yǎng)生活方式、以及H4F-Wood-Ljungdahl(H4F WL)途徑固定CO2的自養(yǎng)生活方式。此外,該新目還具有從頭合成類異戊二烯和核苷酸的潛力,以及硫還原、氫代謝和砷還原等等相關(guān)的基因和通路。比較基因組學(xué)和CODH/ACS蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析表明廣微原體目和馬賽甲烷桿菌目的細(xì)菌型H4F-WL碳固定功能基因可能是來自于厚壁菌門的橫向基因轉(zhuǎn)移。這項(xiàng)研究擴(kuò)展了研究人員對(duì)熱原體綱的系統(tǒng)發(fā)育學(xué)及其代謝多樣性的認(rèn)識(shí),并為熱原體綱內(nèi)不同目之間的進(jìn)化歷程提供了新的見解。
相關(guān)研究以“metagenomic insights into the metabolism and evolution of a new Thermoplasmata order (Candidatus Gimiplasmatales)”為題發(fā)表在環(huán)境微生物學(xué)領(lǐng)域國際權(quán)威期刊《環(huán)境微生物學(xué)》(Environmental Microbiology),廣東省科學(xué)院微生物研究所與華南理工大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)的博士生胡文哲、深圳大學(xué)潘杰副研究員為論文共同第一作者,微生物研究所許玫英研究員和深圳大學(xué)高等研究院李猛教授為論文共同通訊作者。該研究得到國家自然科學(xué)基金委、廣東省重點(diǎn)領(lǐng)域研發(fā)計(jì)劃、廣東省科學(xué)院建設(shè)國內(nèi)一流研究機(jī)構(gòu)行動(dòng)專項(xiàng)資金和深圳市科技計(jì)劃等項(xiàng)目的資助。

